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简介
R 是一种专门用于统计计算和图形的开源编程语言。由 R Foundation for Statistical Computing 支持,它被广泛用于开发统计软件和进行数据分析。R 是一种越来越受欢迎且可扩展的语言,拥有活跃的社区,提供了许多用户生成的针对特定研究领域的软件包,使其适用于许多领域。
在本教程中,我们将安装 R,并展示如何从官方 Comprehensive R Archive Network (CRAN) 添加软件包。
先决条件
要按照本教程进行操作,您需要具有以下配置的 Ubuntu 18.04 服务器:
至少 1GB 的 RAM具有sudo
权限的非根用户 要了解如何实现这种设置,请按照我们的手动初始化服务器设置指南或运行我们的自动化脚本。
一旦满足这些先决条件,您就可以开始了。
步骤 1 — 安装 R
由于 R 是一个快速发展的项目,最新的稳定版本并不总是可以从 Ubuntu 的软件仓库中获取,因此我们将首先添加由 CRAN 维护的外部仓库。
首先,让我们添加相关的 GPG 密钥。
sudo apt-key adv --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-keys E298A3A825C0D65DFD57CBB651716619E084DAB9
当我们运行该命令时,将会收到以下输出:
执行: /tmp/apt-key-gpghome.4BZzh1TALq/gpg.1.sh --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-keys E298A3A825C0D65DFD57CBB651716619E084DAB9gpg: key 51716619E084DAB9: public key "Michael Rutter <marutter@gmail.com>" importedgpg: Total number processed: 1gpg: imported: 1
一旦我们获得了可信任的密钥,我们就可以添加仓库了。
请注意,如果您不使用 18.04 版本,您可以从 R 项目 Ubuntu 列表中找到相应的仓库,每个版本都有一个命名。Ubuntu 18.04 的名称是 Bionic Beaver,而 R 的最新版本是 4.0,因此命名约定为 ubuntu bionic-cran40
。
sudo add-apt-repository 'deb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu bionic-cran40/'
在显示的输出中,您应该识别出类似以下的行:
...Get:4 https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu bionic-cran40/ InRelease [3626 B] ... Get:22 https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu bionic-cran40/ Packages [20.4 kB]...
现在,我们需要在此之后运行 update
命令,以便从新仓库中包含软件包清单。
sudo apt update
输出中应该包含类似以下的行:
...Hit:1 https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu bionic-cran40/ InRelease...
如果上述行出现在 update
命令的输出中,我们已成功添加了仓库。我们可以确保不会意外安装旧版本。
此时,我们已准备好使用以下命令安装 R。
sudo apt install r-base
如果提示确认安装,请按 y
继续。
截至撰写本文时,CRAN 的最新稳定版本是 4.0.1,在启动 R 时会显示。
由于我们计划为系统上的每个用户安装一个示例软件包,因此我们将以 root 用户身份启动 R,这样库将自动对所有用户可用。或者,如果您在没有 sudo
的情况下运行 R
命令,可以为您的用户设置一个个人库。
sudo -i R
R version 4.0.0 (2020-04-24) -- "Arbor Day"Copyright (C) 2020 The R Foundation for Statistical ComputingPlatform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)...Type 'demo()' for some demos, 'help()' for on-line help, or'help.start()' for an HTML browser interface to help.Type 'q()' to quit R.>
这证实我们已成功安装了 R 并进入了其交互式 shell。
步骤 2 — 从 CRAN 安装 R 软件包
R 的强大之处之一在于其丰富的附加软件包。为了演示目的,我们将安装 txtplot
,一个输出包括散点图、折线图、密度图、acf 和条形图的 ASCII 图形的库:
install.packages('txtplot')
安装完成后,我们可以加载 txtplot
:
library('txtplot')
如果没有错误消息,说明库已成功加载。现在让我们使用一个示例来演示其基本绘图功能,该示例演示了一个包含汽车速度和根据 1920 年代的数据计算的停车距离的示例数据,该数据由 R 的 datasets
软件包提供:
txtplot(cars[,1], cars[,2], xlab = 'speed', ylab = 'distance')
+----+-----------+------------+-----------+-----------+--+ 120 + * + | |d 100 + * +i | * * |s 80 + * * +t | * * * * |a 60 + * * * * * +n | * * * * * |c 40 + * * * * * * * +e | * * * * * * * | 20 + * * * * * + | * * * | 0 +----+-----------+------------+-----------+-----------+--+ 5 10 15 20 25 speed
如果您有兴趣了解更多关于 txtplot
的信息,请在 R 解释器中使用 help(txtplot)
。
可以使用 install.packages()
从 CRAN 安装任何预编译软件包。要了解更多可用内容,您可以在 Available CRAN Packages By Name 列表中按名称查找官方软件包的列表。
要退出 R,您可以输入 q()
。除非您想保存工作区图像,否则在提示时按 n
。
结论
成功在您的服务器上安装了 R 之后,您可能会对安装 RStudio 服务器的指南感兴趣,以便为您刚刚完成的基于服务器的部署带来一个集成开发环境。您还可以学习如何设置 Shiny 服务器,将您的 R 代码转换为交互式网页。
要了解如何通过不同工具安装 R 包的更多信息,您可以阅读有关如何直接从 GitHub、BitBucket 或其他位置安装的指南。这将使您能够充分利用活跃社区的最新工作。