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【pytorch】从零开始用语义分割网络(deeplab3+)训练自己的数据集

14 人参与  2023年04月02日 09:37  分类 : 《随便一记》  评论

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参考文档:
https://blog.csdn.net/qq_43631789/article/details/102700231
https://blog.csdn.net/qq_39056987/article/details/106455828
https://blog.csdn.net/qq_36766560/article/details/110009622
https://blog.csdn.net/gsgs1234/article/details/115267777

1. 制作自己数据集(labelme)

使用labelme对自己采集的图像进行标注。
安装和使用过程略。
在这里插入图片描述
然后标注的json文件默认保存在图像所在的目录内。标注完成之后一般是这样的:
在这里插入图片描述

2. 下载deeplab3+源码包(pytorch)

github地址:
https://github.com/jfzhang95/pytorch-deeplab-xception
下载代码包至自己的指定位置:
在这里插入图片描述

3. 将数据集转换为VOC格式

3.1 数据结构介绍

我们首先新建一些列文件夹,文件结构如下:

- ImageSets- Segmentation- train.txt-train.txt- val.txt- JPEGImages- SegmentationClass

ImageSets目录内单放一个Segmentation文件夹,然后Segmentation目录下需要制作3个txt文件:train.txt,train.txt,val.txt 用来表示训练集,验证集,测试集的划分信息。制作方式后面介绍。

JPEGImages 目录内用于存放图像数据集的原图。

在这里插入图片描述
SegmentationClass 目录放置的mask图像,mask是原图根据标注信息json文件生成的,生成方式后面介绍,注意mask的图像与原图的名称一一对应。

在这里插入图片描述

3.2 生成3个txt文件

txt的格式是每一行一个图像文件名,无后缀,不需要地址。
在这里插入图片描述
train,trainval,val自己按照一定比例划分
代码如下:

import osimport numpy as nproot = r"D:\dataset\belt\JPEGImages"output = r"D:\dataset\belt\ImageSets\Segmentation"filename = []#从存放原图的目录中遍历所有图像文件# dirs = os.listdir(root)for root, dir, files in os.walk(root):    for file in files:        print(file)        filename.append(file[:-4])  # 去除后缀,存储#打乱文件名列表np.random.shuffle(filename)#划分训练集、测试集,默认比例6:2:2train = filename[:int(len(filename)*0.6)]trainval = filename[int(len(filename)*0.6):int(len(filename)*0.8)]val = filename[int(len(filename)*0.8):]#分别写入train.txt, test.txtwith open(os.path.join(output,'train.txt'), 'w') as f1, open(os.path.join(output,'trainval.txt'), 'w') as f2,open(os.path.join(output,'val.txt'), 'w') as f3:    for i in train:        f1.write(i + '\n')    for i in trainval:        f2.write(i + '\n')    for i in val:        f3.write(i + '\n')print('成功!')

3.3 根据json,制作对应的mask图像

我们首先将所有的json文件存放到单独的文件夹,实例中表示为: "D:\\dataset\\json"

制作mask的图像需要用到labelme的源码。

我们首先找到labelme源码的安装位置:
用anaconda安装的话,windows一般是Users\用户名\.conda\envs\环境名\Lib\site-packages\labelme
然后找到labelme\cli的位置,先备份一下原来的json_to_dataset.py文件,然后用下面的代码覆盖掉原来的json_to_dataset.py。
在这里插入图片描述

import argparseimport base64import jsonimport osimport os.path as ospimport PIL.Imageimport yamlfrom labelme.logger import loggerfrom labelme import utilspath = "D:\\dataset\\json"dirs = os.listdir(path)def label(json_file, out_dir, label_name_to_value):    # print("json.load(open(json_file))=", json_file)    # json_file = os.path.join(path, json_file)    # print("json.load(open(json_file))=", json_file)    data = json.load(open(json_file))    if data['imageData']:        imageData = data['imageData']    else:        imagePath = os.path.join(os.path.dirname(json_file), data['imagePath'])        with open(imagePath, 'rb') as f:            imageData = f.read()            imageData = base64.b64encode(imageData).decode('utf-8')    img = utils.img_b64_to_arr(imageData)    for shape in sorted(data['shapes'], key=lambda x: x['label']):        label_name = shape['label']        if label_name in label_name_to_value:            label_value = label_name_to_value[label_name]        else:            label_value = len(label_name_to_value)            label_name_to_value[label_name] = label_value    lbl = utils.shapes_to_label(img.shape, data['shapes'], label_name_to_value)    label_names = [None] * (max(label_name_to_value.values()) + 1)    for name, value in label_name_to_value.items():        label_names[value] = name    lbl_viz = utils.draw_label(lbl, img, label_names)    PIL.Image.fromarray(img).save(osp.join(out_dir, 'img.png'))    utils.lblsave(osp.join(out_dir, 'label.png'), lbl)    PIL.Image.fromarray(lbl_viz).save(osp.join(out_dir, 'label_viz.png'))    with open(osp.join(out_dir, 'label_names.txt'), 'w') as f:        for lbl_name in label_names:            f.write(lbl_name + '\n')    logger.warning('info.yaml is being replaced by label_names.txt')    info = dict(label_names=label_names)    with open(osp.join(out_dir, 'info.yaml'), 'w') as f:        yaml.safe_dump(info, f, default_flow_style=False)    logger.info('Saved to: {}'.format(out_dir))def main():    logger.warning('This script is aimed to demonstrate how to convert the'                   'JSON file to a single image dataset, and not to handle'                   'multiple JSON files to generate a real-use dataset.')    parser = argparse.ArgumentParser()    parser.add_argument('json_file_dir')    parser.add_argument('-o', '--out', default=None)    args = parser.parse_args()    label_name_to_value = {'_background_': 0}    for json_file in dirs:        # print("json_file=", json_file)        if args.out is None:            json_file = os.path.join(path, json_file)            out_dir = osp.basename(json_file).replace('.', '_')            out_dir = osp.join(osp.dirname(json_file), out_dir)        else:            # out_dir = args.out            json_file = os.path.join(path, json_file)            out_dir = osp.basename(json_file).replace('.', '_')            out_dir = osp.join(osp.dirname(args.out), out_dir)            # print('out_dir=',out_dir)        if not osp.exists(out_dir):            os.mkdir(out_dir)        label(json_file, out_dir, label_name_to_value)if __name__ == '__main__':    main()

然后在cli目录输入命令行:

python .\json_to_dataset.py json_file_dir -o D:\dataset\output_mask\

json_file_dir :必须带的参数
-o :输出目录
然后输出目录就会增加非常多的文件夹:
在这里插入图片描述
每个文件夹下有5个文件,而我们需要将所有的label.png文件放入到VOC格式数据集中的SegmentationClass目录,并且需要改成与原图对应的名称。
在这里插入图片描述
类别放在label_names.txt里,默认会有一个_background_所以我们正常的语义分割至少要有两类。

抽离label.png的脚本:

import osimport shutilinputdir = 'D:\\dataset\\output_mask'outputdir = 'D:\\dataset\\belt\\SegmentationClass'for dir in os.listdir(inputdir):    # 设置旧文件名(就是路径+文件名)    oldname = inputdir + os.sep + dir + os.sep + 'label.png'  # os.sep添加系统分隔符    print("oldname=",oldname)    png_id = ''    print("dir=",oldname)    # 之前的mask命名都是以xxx_json的目录明明,现在需要把最后的_json部分去除,还原原图的名称    for i in range(len(dir.split('_'))) :        if i == len(dir.split('_'))-1:            continue        else:            # 原图的名称中可有可能包含一个或多个_,除了最后一个_,其余都保留。            if png_id != '':                png_id += '_'            png_id += dir.split('_')[i]    # 设置新文件名    newname = outputdir + os.sep + png_id + '.png'    shutil.copyfile(oldname, newname)  # 用os模块中的rename方法对文件改名    print(oldname, '======>', newname)

执行结束后就可以发现SegmentationClass目录内放入了mask图像。
在这里插入图片描述

4. 修改deeplab+源码,增加自己的数据集

4.1 mypath.py 中加入自己数据集的路径

实例中增加的数据集名称为belt

在这里插入图片描述

belt下的文件结构就是之前提到的VOC结构:

-belt- ImageSets- Segmentation- train.txt-train.txt- val.txt- JPEGImages- SegmentationClass

4.2 在dataloaders/datasets目录下添加文件

复制一份pascal.py文件,并重命名为自己的数据集名称
在这里插入图片描述
然后打开自己的数据集py文件,修改文件内的类别数和数据集名称:
在这里插入图片描述

4.3 修改dateloaders目录下utils.py

搜素def get_cityscapes_labels()函数,然后在上方添加自己数据集的函数,例如get_belt_labels().
这个函数的主要意思就是给自己每个类设置一个掩膜颜色,有多少个类,就设置多少种颜色。
在这里插入图片描述

然后在decode_segmap函数内添加代码,其中n_classes是你要分割的类别数在这里插入图片描述

4.4 在dataloaders目录下修改__init__.py

在第一行添加数据集名称,复制’pascal’数据集描述,把名称修改为自己数据集的名字
在这里插入图片描述

    if args.dataset == 'belt':        train_set = belt.VOCSegmentation(args, split='train')        val_set = belt.VOCSegmentation(args, split='val')        num_class = train_set.NUM_CLASSES        train_loader = DataLoader(train_set, batch_size=args.batch_size, shuffle=True, **kwargs)        val_loader = DataLoader(val_set, batch_size=args.batch_size, shuffle=False, **kwargs)        test_loader = None        return train_loader, val_loader, test_loader, num_class

4.5 在同级目录中修改train.py约185行添加自己数据集的名称(可以设置为默认)

在这里插入图片描述

5. 开始训练数据

输入指令:

python train.py --backbone mobilenet --lr 0.007 --workers 1 --epochs 50 --batch-size 8 --gpu-ids 0 --checkname deeplab-mobilenet

模型保存的路径是在代码内是设置的,在saver.py可以看到保存的路径:run/[datasetname]/[checkname],在示例中的路径就是:run/belt/deeplab-mobilenet
保存的目录中可能会存在很多experiment_*的目录,这是每一此训练都会保存在一个experiment_{}的目录内,最新的训练结果保存在最后id的目录上。此外,最优的模型还会保存到run/[datasetname]/[checkname]中的model_best.pth.tar中。
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述

若是出现报错:
AttributeError: ‘DeepLab’ object has no attribute ‘module’
在这里插入图片描述
解决方式:
打开train.py,找到报错的地方 'state_dict': self.model.module.state_dict(),修改为

`'state_dict': self.model.state_dict()

在这里插入图片描述

6. 测试

源码中没有测试代码,需要自己放入一个测试py文件。
修改–in-path为数据集的测试图片,最后的结果保存在–in-path中

## demo.py#import argparseimport osimport numpy as npimport time from modeling.deeplab import *from dataloaders import custom_transforms as trfrom PIL import Imagefrom torchvision import transformsfrom dataloaders.utils import  *from torchvision.utils import make_grid, save_image def main():     parser = argparse.ArgumentParser(description="PyTorch DeeplabV3Plus Training")    parser.add_argument('--in-path', type=str,  default='/root/home/zyx/Seg552_VOC/test',                        help='image to test')    # parser.add_argument('--out-path', type=str, required=True, help='mask image to save')    parser.add_argument('--backbone', type=str, default='resnet',                        choices=['resnet', 'xception', 'drn', 'mobilenet'],                        help='backbone name (default: resnet)')    parser.add_argument('--ckpt', type=str, default='deeplab-resnet.pth',                        help='saved model')    parser.add_argument('--out-stride', type=int, default=16,                        help='network output stride (default: 8)')    parser.add_argument('--no-cuda', action='store_true', default=False,                        help='disables CUDA training')    parser.add_argument('--gpu-ids', type=str, default='0',                        help='use which gpu to train, must be a \                        comma-separated list of integers only (default=0)')    parser.add_argument('--dataset', type=str, default='belt',                        choices=['pascal', 'coco', 'cityscapes','belt'],                        help='dataset name (default: pascal)')    parser.add_argument('--crop-size', type=int, default=513,                        help='crop image size')    parser.add_argument('--num_classes', type=int, default=2,                        help='crop image size')    parser.add_argument('--sync-bn', type=bool, default=None,                        help='whether to use sync bn (default: auto)')    parser.add_argument('--freeze-bn', type=bool, default=False,                        help='whether to freeze bn parameters (default: False)')     args = parser.parse_args()    args.cuda = not args.no_cuda and torch.cuda.is_available()    if args.cuda:        try:            args.gpu_ids = [int(s) for s in args.gpu_ids.split(',')]        except ValueError:            raise ValueError('Argument --gpu_ids must be a comma-separated list of integers only')     if args.sync_bn is None:        if args.cuda and len(args.gpu_ids) > 1:            args.sync_bn = True        else:            args.sync_bn = False    model_s_time = time.time()    model = DeepLab(num_classes=args.num_classes,                    backbone=args.backbone,                    output_stride=args.out_stride,                    sync_bn=args.sync_bn,                    freeze_bn=args.freeze_bn)model = nn.DataParallel(model)    ckpt = torch.load(args.ckpt, map_location='cpu')    model.load_state_dict(ckpt['state_dict'])    model = model.cuda()    model_u_time = time.time()    model_load_time = model_u_time-model_s_time    print("model load time is {}".format(model_load_time))     composed_transforms = transforms.Compose([        tr.Normalize(mean=(0.485, 0.456, 0.406), std=(0.229, 0.224, 0.225)),        tr.ToTensor()])    for name in os.listdir(args.in_path):        s_time = time.time()        image = Image.open(args.in_path+"/"+name).convert('RGB')         # image = Image.open(args.in_path).convert('RGB')        target = Image.open(args.in_path+"/"+name).convert('L')        sample = {'image': image, 'label': target}        tensor_in = composed_transforms(sample)['image'].unsqueeze(0)         model.eval()        if args.cuda:            tensor_in = tensor_in.cuda()        with torch.no_grad():            output = model(tensor_in)         grid_image = make_grid(decode_seg_map_sequence(torch.max(output[:3], 1)[1].detach().cpu().numpy()),                                3, normalize=False, range=(0, 255))        save_image(grid_image,args.in_path+"/"+"{}_mask.png".format(name[0:-4]))        u_time = time.time()        img_time = u_time-s_time        print("image:{} time: {} ".format(name,img_time))        # save_image(grid_image, args.out_path)        # print("type(grid) is: ", type(grid_image))        # print("grid_image.shape is: ", grid_image.shape)    print("image save in in_path.")if __name__ == "__main__":   main() # python demo.py --in-path your_file --out-path your_dst_file 

注意点:
参数--dataset代码中加入自己的类:

    parser.add_argument('--dataset', type=str, default='belt',                        choices=['pascal', 'coco', 'cityscapes','belt'],                        help='dataset name (default: pascal)')

输入测试指令:

 python testdemo.py --dataset belt --num_classes 2 --ckpt run/Seg552/deeplab-mobilenet/checkpoint.pth.tar --backbone mobilenet 

常见报错:

1. state_dict错误

在这里插入图片描述

RuntimeError: Error(s) in loading state_dict for DeepLab:         Missing key(s) in state_dict: "

在原版中会出现,在ckpt = torch.load(args.ckpt, map_location='cpu')之前加入 model = nn.DataParallel(model) 即可。

2. CUDA报错

在这里插入图片描述

报错如下:raise AssertionError("Torch not compiled with CUDA enabled") AssertionError: Torch not compiled with CUDA enabled
解决方式:

可能是在gpu上训练,用了torch-cpu,检查torch版本。如果版本没问题,注释掉:
    model = model.cuda()

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