来源: “码农不会写诗”公众号
链接:全网最简单Lammps(Ubuntu)安装教程
文章目录
1 简介1.1 Lammps1.2 ReaxFF MD 2 安装2.1 方式一:通过apt直接安装(只安装基本模块)2.2 方式二:通过cmake编译安装(可安装可选模块)2.2.1 准备工作2.2.2 下载源码2.2.3 编译安装 3 测试3.1 测试-13.2 测试-2 (ReaxFF MD) 4 获取手把手带教安装PDF文档5 参考文献
书回正文
继续咱的ReaxFF MD之旅,工欲善其事,必先利其器,今天手把手教会Ubuntu安装Lammps,包括REAXFF package。
1 简介
1.1 Lammps
LAMMPS(Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator)是由美国Sandia国家实验室开发的一款大规模原子/分子并行模拟器,主要用于分子动力学相关的一些计算和模拟。LAMMPS开放源代码且可以免费使用,灵活性高、使用范围广,并且具有良好的并行拓展性,支持包括气态、液态和固态下各种系综百万级的原子分子体系计算。
1.2 ReaxFF MD
可选包(Optional packages)是LAMMPS功能的扩展,包是启用一组特定功能的文件组,例如,分子系统的力场或刚体约束都在封装中。ReaxFF力场开发者van Duin建立的ReaxFF MD模拟程序也集成在了Optional packages中,因此跟着ReaxFF MD系列简介一起学习的朋友建议选择以下方式二安装哦~
2 安装
两种方式二选一哦
2.1 方式一:通过apt直接安装(只安装基本模块)
适合不需要安装Optional packages的朋友们,Ref: Download an executable for Linux
sudo apt-get updatesudo apt-get install lammps -y
2.2 方式二:通过cmake编译安装(可安装可选模块)
适合需要安装Optional packages的朋友们,Ref: Build LAMMPS with CMake
2.2.1 准备工作
mkdir -p work/lammpscd work/lammpssudo apt-get updatesudo apt-get install lammps gcc g++ gfortran cmake make build-essential ffmpeg libopenmpi-dev -ysudo apt-get remove lammps -y
2.2.2 下载源码
方式一:下载时间较长,不想等待的朋友看方式二wget https://download.lammps.org/tars/lammps-stable.tar.gz
方式二: 关注